夜間開園時に普段見ることができない動物たちの夜の姿を観察できるイベント。動物の生態をより深く理解することができる。ナイトZOO期間中は17時頃からライトアップやバックミュージックが放送され、ナイトZOOの雰囲気を楽しめる。開催月によって動物舎の観覧可能時間が異なり、8月は18時30分まで、9月は18時までの施設が多い。動物の体調管理の都合上、開催日によって観覧時間が異なる場合がある。フラッシュ撮影や動物に向かってのライト使用は禁止。園内へのアルコール持ち込みや飲酒後の入園もできない。